《棒球大联盟2nd》延续了前作的世界观，将故事舞台设定在前作主角茂野吾郎成为职业选手之后。主角茂野大吾是吾郎的儿子，目前就读小学六年级。由于父亲巨大的成就和名声，大吾在打棒球时承受着“名人之子”的压力，内心充满矛盾，既想追随父亲的脚步，又渴望走出属于自己的道路。大吾转学到了风林小学，并加入了该校的棒球队。然而，这支队伍实力薄弱，缺乏斗志。在这里，他遇到了性格各异的新队友，包括实力强劲但有些孤傲的佐藤光。大吾必须学习如何融入团队，与队友们磨合，共同面对强大的对手。作品细腻刻画了少年们在训练和比赛中建立的友谊、经历的冲突以及在失败中学习成长的历程。动画不仅展现了紧张激烈的比赛场面，更深入探讨了亲子关系、梦想传承与自我价值实现的主题。大吾的棒球之路，是一场挣脱父亲光环、寻找自身“生存之道”的冒险，激励着新一代观众。