《机巧魔神》第一季围绕着平凡高中生夏目智春展开，他因被已故青梅竹马水无神操绪的幽灵附体而困扰。入学后，神秘转学生黑崎朱浬将名为“机巧魔神”的银色手提箱托付给他，智春由此被卷入超自然战斗的世界。他被迫与被称为“恶魔”的异界存在对抗，并逐渐发现自己成为关键的“恶魔使”。在战斗与谜团中，智春结识了多位拥有机巧魔神的同伴，共同面对威胁世界的危机。他们必须解开操绪死亡的真相、机巧魔神的起源以及隐藏在背后的庞大组织阴谋。本作融合校园生活、科幻机甲与超自然元素，描绘主角们在残酷命运中挣扎成长的故事。随着剧情推进，智春不仅要保护世界，更要面对自身能力的代价与同伴间的羁绊考验。